MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 chromosome

Total Repeats: 94577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017646	CGG	2	6	352	357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386622415
2	NC_017646	CAGG	2	8	418	425	25 %	0 %	50 %	25 %	386622415
3	NC_017646	CT	3	6	443	448	0 %	50 %	0 %	50 %	386622415
4	NC_017646	ACCA	2	8	464	471	50 %	0 %	0 %	50 %	386622415
5	NC_017646	TGG	2	6	474	479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386622415
6	NC_017646	GAT	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622415
7	NC_017646	A	6	6	489	494	100 %	0 %	0 %	0 %	386622415
8	NC_017646	CGC	2	6	568	573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386622415
9	NC_017646	TCG	2	6	612	617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622415
10	NC_017646	TTG	2	6	662	667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622415
11	NC_017646	CGCTG	2	10	691	700	0 %	20 %	40 %	40 %	386622415
12	NC_017646	GC	3	6	752	757	0 %	0 %	50 %	50 %	386622415
13	NC_017646	CTG	2	6	794	799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622415
14	NC_017646	CCG	2	6	847	852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386622415
15	NC_017646	CCG	2	6	906	911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386622415
16	NC_017646	TGG	2	6	930	935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386622415
17	NC_017646	ACT	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622415
18	NC_017646	CTG	2	6	963	968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622415
19	NC_017646	GCTG	2	8	973	980	0 %	25 %	50 %	25 %	386622415
20	NC_017646	TTG	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622415
21	NC_017646	GGAC	2	8	1011	1018	25 %	0 %	50 %	25 %	386622415
22	NC_017646	GTT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622415
23	NC_017646	TTC	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386622415
24	NC_017646	TGA	2	6	1231	1236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622415
25	NC_017646	GGC	2	6	1327	1332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386622415
26	NC_017646	GC	3	6	1331	1336	0 %	0 %	50 %	50 %	386622415
27	NC_017646	GTG	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386622415
28	NC_017646	ATC	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622415
29	NC_017646	TG	3	6	1433	1438	0 %	50 %	50 %	0 %	386622415
30	NC_017646	AAG	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386622415
31	NC_017646	GGT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386622415
32	NC_017646	TCT	2	6	1634	1639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386622415
33	NC_017646	CGT	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622415
34	NC_017646	GAT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622415
35	NC_017646	TCA	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622415
36	NC_017646	GCT	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622415
37	NC_017646	GAA	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386622415
38	NC_017646	GAA	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386622415
39	NC_017646	ATC	2	6	1965	1970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622415
40	NC_017646	TTG	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622415
41	NC_017646	CCAG	2	8	2001	2008	25 %	0 %	25 %	50 %	386622415
42	NC_017646	GTT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622415
43	NC_017646	TCG	2	6	2084	2089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622415
44	NC_017646	TAC	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622415
45	NC_017646	GCG	2	6	2117	2122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386622415
46	NC_017646	TGA	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622415
47	NC_017646	TGA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622415
48	NC_017646	GAT	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622415
49	NC_017646	ATTGAA	2	12	2429	2440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386622415
50	NC_017646	TGC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622415
51	NC_017646	CGA	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386622415
52	NC_017646	CG	4	8	2524	2531	0 %	0 %	50 %	50 %	386622415
53	NC_017646	TGA	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622415
54	NC_017646	TGA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622415
55	NC_017646	TAT	2	6	2684	2689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622415
56	NC_017646	GCG	2	6	2862	2867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386622416
57	NC_017646	GGC	2	6	2915	2920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386622416
58	NC_017646	CAA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386622416
59	NC_017646	GGT	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386622416
60	NC_017646	ATGA	2	8	3126	3133	50 %	25 %	25 %	0 %	386622416
61	NC_017646	GCA	2	6	3205	3210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386622416
62	NC_017646	GGT	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386622416
63	NC_017646	TGA	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622416
64	NC_017646	GAA	2	6	3264	3269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386622416
65	NC_017646	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622416
66	NC_017646	CAGC	2	8	3281	3288	25 %	0 %	25 %	50 %	386622416
67	NC_017646	TGA	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622416
68	NC_017646	CGC	2	6	3384	3389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386622416
69	NC_017646	ATTGC	2	10	3394	3403	20 %	40 %	20 %	20 %	386622416
70	NC_017646	TGA	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622416
71	NC_017646	AGCG	2	8	3563	3570	25 %	0 %	50 %	25 %	386622416
72	NC_017646	TCCGGC	2	12	3576	3587	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386622416
73	NC_017646	TG	3	6	3604	3609	0 %	50 %	50 %	0 %	386622416
74	NC_017646	CGG	2	6	3703	3708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386622416
75	NC_017646	CTGA	2	8	3849	3856	25 %	25 %	25 %	25 %	386622417
76	NC_017646	TGA	2	6	3860	3865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622417
77	NC_017646	TGA	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622417
78	NC_017646	CG	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	386622417
79	NC_017646	CGG	2	6	4058	4063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386622417
80	NC_017646	GGC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386622417
81	NC_017646	TGA	3	9	4322	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622417
82	NC_017646	CTA	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622417
83	NC_017646	GC	3	6	4440	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	386622417
84	NC_017646	CGG	2	6	4492	4497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386622417
85	NC_017646	CTG	2	6	4500	4505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622417
86	NC_017646	ACG	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386622417
87	NC_017646	AAC	2	6	4650	4655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386622417
88	NC_017646	GTT	2	6	4673	4678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622417
89	NC_017646	CCG	2	6	4679	4684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386622417
90	NC_017646	GAT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622417
91	NC_017646	AG	3	6	4880	4885	50 %	0 %	50 %	0 %	386622417
92	NC_017646	CCG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386622417
93	NC_017646	TGC	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622417
94	NC_017646	TGA	3	9	4999	5007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622417
95	NC_017646	ATC	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622417
96	NC_017646	TGG	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386622418
97	NC_017646	ACA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386622418
98	NC_017646	CCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386622418
99	NC_017646	CGC	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386622418
100	NC_017646	ATC	2	6	5482	5487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622418
101	NC_017646	ATC	2	6	5494	5499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622418
102	NC_017646	CAT	2	6	5517	5522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622418
103	NC_017646	GCT	2	6	5573	5578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622419
104	NC_017646	GGA	2	6	5610	5615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386622419
105	NC_017646	TCA	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622419
106	NC_017646	AAG	2	6	5626	5631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386622419
107	NC_017646	CAGT	2	8	5651	5658	25 %	25 %	25 %	25 %	386622419
108	NC_017646	AAT	2	6	5685	5690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622419
109	NC_017646	TCA	2	6	5699	5704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622419
110	NC_017646	TGA	2	6	5732	5737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622419
111	NC_017646	TTC	2	6	5752	5757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386622419
112	NC_017646	TTC	2	6	5797	5802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386622419
113	NC_017646	CAC	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386622419
114	NC_017646	TGC	2	6	5862	5867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622419
115	NC_017646	TTG	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622419
116	NC_017646	TGA	2	6	5891	5896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622419
117	NC_017646	AAATCG	2	12	6037	6048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386622419
118	NC_017646	AGCG	2	8	6155	6162	25 %	0 %	50 %	25 %	386622419
119	NC_017646	GCT	2	6	6245	6250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622419
120	NC_017646	GTG	2	6	6286	6291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386622419
121	NC_017646	GCC	2	6	6645	6650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386622420
122	NC_017646	GTT	2	6	6699	6704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622420
123	NC_017646	AGA	2	6	6716	6721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386622420
124	NC_017646	ATC	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622420
125	NC_017646	CGC	2	6	6987	6992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386622420
126	NC_017646	TGCCGC	2	12	6993	7004	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386622420
127	NC_017646	CGC	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386622420
128	NC_017646	GCC	2	6	7095	7100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386622420
129	NC_017646	GCCA	2	8	7112	7119	25 %	0 %	25 %	50 %	386622420
130	NC_017646	CAG	2	6	7272	7277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386622420
131	NC_017646	AAT	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622420
132	NC_017646	GGA	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386622420
133	NC_017646	CG	3	6	7439	7444	0 %	0 %	50 %	50 %	386622420
134	NC_017646	AGA	2	6	7565	7570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386622420
135	NC_017646	CGG	2	6	7586	7591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386622420
136	NC_017646	GCCA	2	8	7608	7615	25 %	0 %	25 %	50 %	386622420
137	NC_017646	CG	3	6	7631	7636	0 %	0 %	50 %	50 %	386622420
138	NC_017646	CAA	2	6	7765	7770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386622420
139	NC_017646	TAA	2	6	7820	7825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622420
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141	NC_017646	GCAT	2	8	7841	7848	25 %	25 %	25 %	25 %	386622420
142	NC_017646	CAAC	2	8	8220	8227	50 %	0 %	0 %	50 %	386622421
143	NC_017646	TC	3	6	8231	8236	0 %	50 %	0 %	50 %	386622421
144	NC_017646	CGCAG	2	10	8245	8254	20 %	0 %	40 %	40 %	386622421
145	NC_017646	TTGA	2	8	8273	8280	25 %	50 %	25 %	0 %	386622421
146	NC_017646	CAG	2	6	8303	8308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386622421
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148	NC_017646	CAG	2	6	8324	8329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386622421
149	NC_017646	CGAC	2	8	8340	8347	25 %	0 %	25 %	50 %	386622421
150	NC_017646	TGC	2	6	8545	8550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622421
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153	NC_017646	TTG	2	6	8655	8660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622421
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155	NC_017646	AGA	2	6	8716	8721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386622421
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159	NC_017646	GCA	2	6	8971	8976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386622421
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161	NC_017646	CTG	2	6	9068	9073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622421
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165	NC_017646	ATC	2	6	9347	9352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622422
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171	NC_017646	CGTAC	2	10	9673	9682	20 %	20 %	20 %	40 %	386622422
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261	NC_017646	GGC	2	6	14358	14363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386622427
262	NC_017646	GTC	2	6	14371	14376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622427
263	NC_017646	GCG	2	6	14382	14387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386622427
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269	NC_017646	GTCATG	2	12	14650	14661	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386622427
270	NC_017646	GCA	2	6	14674	14679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386622427
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282	NC_017646	ATC	2	6	15416	15421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622428
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286	NC_017646	ATC	2	6	16102	16107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386622429
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291	NC_017646	T	6	6	16461	16466	0 %	100 %	0 %	0 %	386622429
292	NC_017646	TA	3	6	16473	16478	50 %	50 %	0 %	0 %	386622429
293	NC_017646	AATC	2	8	16488	16495	50 %	25 %	0 %	25 %	386622429
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382	NC_017646	TTTA	2	8	21264	21271	25 %	75 %	0 %	0 %	386622433
383	NC_017646	ATT	2	6	21328	21333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622433
384	NC_017646	CGC	2	6	21520	21525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386622433
385	NC_017646	GCT	2	6	21555	21560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622433
386	NC_017646	CCAC	2	8	21567	21574	25 %	0 %	0 %	75 %	386622433
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